据当地向氏族谱记载，清乾隆时的武陵源，“草木畅茂，荒郊旷野，道路俱系羊肠小径，崎岖多险，兽蹄鸟迹交错于道。山则有熊、豕、鹿、豺、狼、虎、豹诸兽，成群结队，咸若有性。水则有双鳞金鲤、重唇诸色之鱼，举网即得，其味脆而甘味”。随着人为活动增加，野生动物渐减，但至20世纪90年代，武陵源仍属野生动物王国。    武陵源现存野生动物属东洋界华中区两部山地高原亚区（郑作新教授区系），东北部接鄂西北神龙架，西南连黔东北梵净山世界生物圈保护区网，位于中国西部山地高原与东部丘陵平原亚区交界线左侧边缘。境内溪壑纵横，树草丰茂，水质清纯，许多地方人烟稀少，人迹罕至。幽静的生态环境，为野生动物的栖息和繁衍提供了理想的条件。飞禽、走兽、鱼蛇、昆虫，种类繁多，有许多珍稀种群。据1980年中国科学院华南考察队考察，境内有陆生脊椎野生动物22目、58科、149种。以鸟类居多，占种数46.9％；其次为兽类，占28.9％；爬行类占16.1％；两栖类占8.1％。属国家一类保护的3种：豹、云豹、黄腹角雉；国家二类保护的25种：猕猴、短尾猴、苏门羚、穿山甲、黑熊、大灵猫、小灵猫、水獭、林麝、水鹿、豺、鸳鸯、鸢、雀鹰、松雀鹰、红腹角雉、白冠长尾雉、红腹锦鸡、褐翅鸦鹃、草鴞、斑头鹇鶹、短耳鴞、长耳鴞、虎纹蛙、大鲵。其中18种被列入《濒危野生动植物国际贸易公约》。属湖南省级保护的有獐、毛冠鹿、红嘴相思鸟等54种。还有脆蛇晰、丽纹蛇、渔游蛇以及索溪峪景区野人井内通体透明的盲眼鱼等奇异动物。

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